La microbiologie industrielle est une branche de la microbiologie appliquée dans laquelle les 

micro-organismes sont utilisés pour la production de substances importantes. Les fermentations industrielles concernent un grand nombre de secteurs : l’alimentaire, la 

santé, l’environnement, l’agriculture et l’élevage, la chimie, et les ressources énergétiques.

Un processus de fermentation typique comporte des étapes de traitement en amont et de 

traitement en aval.

Un micro-organisme est cultivé dans des conditions physico-chimiques contrôlées au sein d’une 

enceinte de grand volume spécialement conçu à cet effet : le fermenteur. 

Les fermenteurs modernes sont généralement intégrés à des ordinateurs pour une surveillance 

efficace des processus, l'acquisition de données, etc.

En industrie, les biofilms peuvent être de deux types : bénéfiques ou nuisibles. 

La majorité des cultures microbiennes, réalisées à des fins de productions biotechnologiques, 

concernent des micro-organismes aérobies. Ces cultures nécessitent donc la fourniture de grandes quantités d'oxygène stériles qui doivent 

être dispersées dans tout le fermenteur.

Ce cours est destiné aux étudiants de Master 1 Biologie Moléculaire des Micro-organismes (BMM).

L'objectif est de donner aux étudiants une bonne connaissance de l'approche intégrative du métabolisme bactérien et de ses applications dans les procédés industriels. 

Donner un aperçu détaillé de l’utilisation des microorganismes dans les IAA et des problèmes liés à la présence dans les denrées alimentaires d’une microflore d’altération, la composition de cette microflore et les pathogènes qu’elle peut éventuellement contenir.