Contenu de la matière :
1. Introduction à la génomique
2. Génomique Structurale :
- génomes des eucaryotes :
→ Organisation des séquences génomiques
→ Gène fonctionnels à copie unique
→ ADN répétitif : - [Sequences fonctionnelles (Les familles de gènes dispersés, Famille de gènes répétés en tandem, Sequences fonctionnelles non codantes]
-[les sequences non fonctinnelles (L’ADN hautement répété encadrant le centromère : ADN satellite, Répétition en tandem en nb variable VNTR : variable number tandem repeat, Les éléments transposables, les Rétrosposons, ADN Intercalaire: Spacer, Empreinte génétique, et gènes d’empreinte)]
- Génomes procaryotes :
→ Taille et Organisation des Génomes procaryotes
→ Génome des eubactéries
→ Génome des Archae
-Méthodes d’études de génome
→ Notions de polymorphisme,
Cartographie d’un génome par séquençage (La méthode hiérarchique, La méthode aléatoire : WGS : Whole Genome Shotgun, l’analyse génomique, compilation des séquences, Annotation de la séquence,
3. Génomique Comparative
4. Génomique fonctionnelle (Génétique classique et mutations pour chercher la fonction des Gènes: génétique directe, La génétique inverse)
5. Analyse des Transcriptomes (les puces à ADN, Serial Analysis of Gene Expression : SAGE Technique)
6. Protéomique (Annotation des protéines).
Cours destiné aux étudiants Master1 Immunologie Moléculaire et Cellulaire.
1. Introduction à la génomique
2. Génomique Structurale :
- génomes des eucaryotes :
→ Organisation des séquences génomiques
→ Gène fonctionnels à copie unique
→ ADN répétitif : - [Sequences fonctionnelles (Les familles de gènes dispersés, Famille de gènes répétés en tandem, Sequences fonctionnelles non codantes]
-[les sequences non fonctinnelles (L’ADN hautement répété encadrant le centromère : ADN satellite, Répétition en tandem en nb variable VNTR : variable number tandem repeat, Les éléments transposables, les Rétrosposons, ADN Intercalaire: Spacer, Empreinte génétique, et gènes d’empreinte)]
- Génomes procaryotes :
→ Taille et Organisation des Génomes procaryotes
→ Génome des eubactéries
→ Génome des Archae
-Méthodes d’études de génome
→ Notions de polymorphisme,
Cartographie d’un génome par séquençage (La méthode hiérarchique, La méthode aléatoire : WGS : Whole Genome Shotgun, l’analyse génomique, compilation des séquences, Annotation de la séquence,
3. Génomique Comparative
4. Génomique fonctionnelle (Génétique classique et mutations pour chercher la fonction des Gènes: génétique directe, La génétique inverse)
5. Analyse des Transcriptomes (les puces à ADN, Serial Analysis of Gene Expression : SAGE Technique)
6. Protéomique (Annotation des protéines).
Cours destiné aux étudiants Master1 Immunologie Moléculaire et Cellulaire.
- Enseignant: ben latreche Moufida