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Ce cours destiné aux étudiants de master en biotechnologie et contrôle qualité couvre divers aspects fondamentaux de la chimie organique à travers cinq chapitres distincts. Le premier aborde la nomenclature chimique, mettant l'accent sur la nomenclature des hydrocarbures, des composés à groupement fonctionnel et des composés hétérocycliques, incluant l'étude de la stéréochimie. Le deuxième chapitre se penche sur la cinétique de la réaction chimique, incluant la théorie des collisions, les diagrammes énergétiques, l'énergie d'activation, les états de transition, ainsi que sur les intermédiaires tels que les radicaux, les carbocations et les carbanions. La classification des solvants et les effets de solvant font également l'objet de discussions approfondies. Le troisième chapitre aborde les réactions fondamentales de la chimie organique, telles que les réactions de substitution, d'addition, d'élimination, d'oxydation, de réduction et les réarrangements. Chaque type de réaction est illustré par des exemples concrets, comme l'alkylation de Friedel–Crafts ou l'époxydation. Le quatrième chapitre introduit les étudiants à la synthèse asymétrique, explorant l'importance des groupements fonctionnels et de la stéréochimie dans la détermination de l'action, de la stabilité et de la toxicité des médicaments. La stéréospécificité, la reconnaissance moléculaire, et différentes méthodes d'obtention de stéréo-isomères purs sont discutées à travers des exemples concrets. Enfin, le cinquième chapitre conclut le cours par une exploration de la synthèse totale à travers des exemples spécifiques tels que l'aspirine, le paracétamol, la sulfanilamide, la Levofloxacin et l'Oseltamivir Phosphate (Tamiflu®). Chaque étape de la synthèse est détaillée, mettant en lumière le rôle de chaque espèce chimique utilisée.
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