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Ce module est destiné aux étudiants de niveau 3eme année licence en microbiologie. Il  consiste à étudier la diversité microorganismes procaryotes, regroupés dans les domaines des archées et des bactéries à travers leur classification, leur nomenclature et leur identification. La classification traditionnelle des procaryotes se basait sur des caractéristiques morphologiques, biochimiques et physiologiques. Cependant, en raison des progrès de la taxonomie moléculaire et de la génomique et avec l'avènement des techniques de séquençage de l'ADN, la classification s'est orientée vers une approche phylogénétique basée sur la comparaison de similarités dans les séquences génétiques. Actuellement, toute approche taxonomique dois prendre en compte un maximum de données de différentes natures pour classer au mieux microorganismes procaryotes, c'est l'approche polyphasiques. 

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